13 декабря 2015 года на публичных слушаниях по проекту бюджета ЗАТО Северск на 2016 год с содокладом выступил Председатель Счетной палаты ЗАТО Северск Балашков С.В. Руководителем контрольного органа были представлены материалы экспертизы проекта бюджета на 2016 год. Как отмечено в докладе, в целом представленный проект и прилагаемые к нему документы соответствуют требованиям Бюджетного кодекса РФ. Цель и все задачи бюджетной политики ЗАТО Северск отвечают условиям основных направлений бюджетной политики федерального уровня и Томской области на предстоящий период 2016-2018 годов. В соответствии с бюджетной политикой Российской федерации и Томской области бюджет ЗАТО Северск сформирован по программному принципу. Вместе с тем, проведенные Счетной палатой экспертизы действующих с 2015 года муниципальных программ выявили отдельные недостатки в содержании и направленности муниципальных программ. Как неоднократно отмечалось Счетной палатой, действующие муниципальные программы финансируются не в полном объеме от заявленной потребности, что создает риски недостижения показателей результативности программ.
Традиционно Счетной палатой по результатам экспертизы в адрес Администрации ЗАТО Северск вынесены рекомендации, среди которых сделан акцент на повышение эффективности использования инвестиционных средств и совершенствование закупочной деятельности учреждений.